新疆理化技术研究所是2002年3月28日整合成立，它的前身是1961年建立的原中国科学院新疆物理研究所和新疆化学研究所。研究所的定位是紧紧围绕国家、自治区战略需求，坚持以科技创新为中心，以提高关键技术创新和系统集成能力为主线，以对新疆社会和经济发展做出有显示度的贡献为目标，成为中国科学院服务新疆的“桥头堡”和高新技术创新、集成，转移的基地，最终发展成为西部乃至中亚一流的高技术研发机构。通过近50年不懈地开拓、创新，已为边疆少数民族地区的经济、社会发展和科技进步做出了突出的贡献。
新疆理化所2002年5月进入中国科学院知识创新工程，这是中国科学院党组部署知识创新工程的重大战略决策，也使新疆理化所面临着最好的发展机遇，进入到了崭新的历史时期。经过几年的创新实践，各方面都发生了巨大地变化，科技创新能力全面得到了提升。同时，我们也清醒地看到，机遇和挑战并存，只有不断创新跨越，才会求得持续、快速地发展。
新疆理化所一直致力与知识创新工程相适应的管理和文化机制的创新，凝炼了“民主、求实、协力、创新”的研究所精神。全所各民族职工团结协作、同心协力，为构建我国和新疆科技创新体系建设，促进边疆高技术技术和产业的发展，做出具有显示度的贡献。
新疆理化所的成长和发展，从来都与中国科学院、新疆和兄弟院所的关心、支持密切相连。我们期望着同更多的国内、外的科研机构、高校和企业进一步加强广泛地交流和合作，并诚邀海内外的优秀人才来所工作，为新疆理化所更加美好的明天而共同努力奋斗！
