新疆特有药用资源利用重点实验室于2002年4月经自治区科技厅批准成立，是自治区首批省级重点实验室，2009年12月被科技部批准为省部共建国家重点实验室培育基地。
1. 总体定位
实验室紧紧围绕国家和新疆的战略需求，坚持以科技创新为中心，以市场需求为导向，以中亚干旱区特种药用资源为对象，研究药效物质基础、生物活性与作用机理、结构修饰与构效关系，为新药研发提供先导化合物或活性组分；建立功能配套的创新药物研发平台，开展新药研究和关键技术开发，促进干旱区特色生物产业发展和优势资源可持续利用；广泛开展国内外科技合作，把实验室建成中亚一流、国际知名的干旱区天然药物、民族药现代化发展的研究基地。
2. 主要研究方向及目标
以特有药用资源为研究对象，以民族医药学、天然药物化学、生物有机化学为基础，运用现代分离技术，依托现代化提取分离、功能研究技术平台，开展民族药的药效物质基础及作用机理研究，为维吾尔药现代化和可食植物资源可持续利用研究奠定基础；努力将我室建设成为干旱区天然药物、民族药现代化发展及中西亚地区植物资源可持续利用研究的一流实验室。
3. 主要研究内容
本实验室围绕特色药用资源的开发利用和保护，以药用资源活性成分结构、功能与作用机理为核心，以民族药用资源功能成分研究为突破口，运用植物化学和分子生物学先进手段，发现与表征功能独特的组分和结构新颖的先导化合物，阐明特色药用成分和食品功能因子的作用机理，结合产业化关键技术工艺研发，开发具有自主知识产权的新药。
4. 实验室的地位与影响力
实验室在新疆特色药用资源的开发利用、民族药物质基础研究、生物活性筛选及作用原理等方面的研究已有相当的积累，在民族医药领域已取得了显著的工作成绩，并得到了社会各界的广泛支持，已成长为民族药研究开发领域的重要力量，通过努力搭建技术创新、集成、转移平台，东联西合，与周边具有相近宗教信仰和用药习惯的中亚国家建立了紧密的联系，逐步发挥中国向西开放的桥头堡和大陆桥经济纽带作用，为优势资源可持续利用，提高中医药文化在中亚国家的影响力起到积极的促进作用，在中亚地区天然药物化学研究领域也颇具影响力。
